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miércoles, 8 de abril de 2020

Publicado el interactoma humano: el mapa global de las comunicaciones entre las proteínas humanas

Genética
Redaccion
08/ 04 / 2020
Estudio internacional con participación del CSIC
La proteína SFRP1 (rojo), implicada en el alzhéimer, rodeada de células gliales (verde)
La proteína SFRP1 (rojo), implicada en el alzhéimer, rodeada de células gliales (verde)

Las proteínas mantienen una tupida red de relaciones entre ellas que desempeña un papel central en el funcionamiento del cuerpo humano. Por ello, conocer las relaciones entra cada una de estas piezas es crucial. Por ejemplo, la interacción molecular entre dos proteínas, una vírica y una humana, es la que permite al coronavirus SARS-CoV2 entrar en las células humanas e infectarlas, causando la enfermedad Covid-19. 

Un gran estudio internacional, liderado por Marc Vidal, del Dana-Farber Cancer Institute de Boston (EEUU) con participación de investigadores del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), ha publicado en Nature el mapa global de las comunicaciones entre las proteínas humanas, el llamado interactoma humano, una especie de facebook de las proteínas, que ayudará a comprender mejor los procesos que ocurren en las células humanas y la base molecular de los procesos vitales. 

Estos hallazgos podrían contribuir tanto al conocimiento del origen de diversas enfermedades como al desarrollo de nuevos fármacos. “Este complejo mapa de relaciones, basado en el proteoma humano, analiza e identifica las interacciones moleculares entre proteína y proteína. De modo que nos permite construir un mapa de miles de relaciones, que se puede equiparar al facebook de las proteínas humanas”, ha explicado Javier De Las Rivas, investigador del CSIC, cuyo grupo del Centro de Investigación del Cáncer (CIC-IBMCC, mixto del CSIC y la Universidad de Salamanca) ha participado en el trabajo. 

El mapa permitirá mejorar los estudios de una gran cantidad de funciones celulares fisiológicas y patológicas en los que las relaciones moleculares no estaban claras. “En este mapa se han testado 17.500 proteínas humanas; de modo que, si se estima que el genoma humano codifica unas 20.000 proteínas, este nuevo mapa abarca un 87,5% del proteoma humano”, ha añadido De Las Rivas.

Red social de comunicaciones

 “Decimos que se parece a una red social como facebook porque es un mapa relacional complejo que nos indica con qué amigas se relaciona cada proteína, y que genera una galaxia compleja de conexiones que revela afinidades y funcionalidades concretas. Este nuevo mapa permite comprender cómo se conectan las proteínas entre sí y cómo interactúan a nivel molecular para constituir las máquinas celulares que realizan las distintas funciones en el organismo. 

El interactoma se puede comparar con un mapa de carreteras

Este mapa se puede comparar con un mapa de carreteras que permite identificar los puntos en los que se debe intervenir para garantizar la seguridad de las comunicaciones. Por ello es clave para desvelar, por ejemplo, dianas que permitan desarrollar fármacos que estimulan relaciones perdidas, o que bloquean ciertas relaciones patológicas. El mapa de las relaciones entre las proteínas también es fundamental para comprender la relación que media entre el genotipo y el fenotipo.

En el trabajo han participado grupos de investigación de Canadá, Bélgica, Hungría, Israel, Reino Unido, Italia, Francia y España. La aportación del grupo de investigación dirigido por Javier De Las Rivas, del CIC-IBMCC, ha sido en el campo de la bioinformática y de la biología computacional, analizando estructurando el big data generado por el proyecto.

Esta red social ayudará a comprender los procesos que ocurren en las células, diseñar fármacos y entender el desarrollo de diversas enfermedades Off Redacción Investigación Off

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