Esta pandemia nos está dejando ver las costuras de nuestro país en muchos ámbitos pero, en especial, en el sanitario, que adolece de más problemas de los que pensábamos cuando empezó la pensadilla de la covid-19. El principal: la falta de agilidad en la toma de decisiones y la movilización de recursos.
Tomàs Pumarola, jefe de Microbiología del Hospital del Valle de Hebrón de Barcelona, con estas declaraciones que publicamos el viernes, nos aboca de nuevo a esa lamentable realidad: “Los británicos pueden estar secuenciando el 10% de casos de SARS-CoV-2 y en España podríamos estar en el 1-2%” y “ahora ellos (los británicos) están organizando una red de genofeno (genotipo y fenotipo) para ver cómo cambia el virus y sus implicaciones”. La Comisión Europea, 19 de enero, instó a los países miembros a incrementar la tasa de secuenciación hasta al menos el 5% y, preferiblemente, el 10% de los casos positivos en las pruebas de covid-19.
Ojo, que este no es un asunto de menor importancia que las medidas restrictivas para reducir la propagación del virus, la estrategia nacional de vacunación o la cancelación de cirugías programadas para poder destinar más camas a pacientes con covid-19. Secuenciar este letal coronavirus, como dice Pumarola, “no es para detectar la variante británica u otras sino para identificar las desconocidas y ver si se escapan a las vacunas y los tratamientos existentes”.
El suyo es uno de los varios laboratorios que están secuenciando el SARS-CoV-2 en las comunidades autónomas, en una red coordinada por el Ministerio de Sanidad a través del Centro Nacional de Microbiología (CNM, Instituto de Salud Carlos III). Los resultados de todos ellos se centralizan en el sistema de la Red Nacional de Vigilancia Epidemiológica de España (SiViEs).
Hasta ahí, bien. La cuestión es si el número de laboratorios y el volumen de muestras que secuencian cada uno de ellos (respecto a los casos positivos en sus respectivas áreas geográficas de influencia) es suficiente para vigilar bien el virus y si todos ellos tienen recursos humanos y técnicos y expertís suficiente como para hacer estudios de genotipo y de fenotipo. A las palabras de Pumarola me vuelvo a remitir: con la vigilancia, por desgracia, siempre se va por detrás del SARS-CoV-2, pero la cuestión relevante es “si vamos un centímetro o diez kilómetros por detrás”.
El primer genoma de SARS-CoV-2 se hizo público el 13 de enero de 2020 y en septiembre de 2020 se habían registrado ya en la base de datos del consorcio público GISAID más de 126.000 genomas obtenidos por laboratorios todo el mundo, entre ellos los procedentes de España. El primer análisis genómico en nuestro país fue el de la Unidad Mixta en Infección y Salud Pública de la Universidad de Valencia (UV) y el Grupo de Investigación en Epidemiología Molecular de Fisabio, ambos dirigidos por Fernando González, catedrático de Genética e investigador, y el Servicio de Secuenciación y Bioinformática de Fisabio, que coordinan Giuseppe d’Auria y Llúcia Martínez.
La OMS emitió el 8 de enero de 2021 el informe Secuenciación del genoma del SARS-CoV-2 con fines de salud pública, en el que dice que “la vigilancia mundial de las secuencias genéticas del SARS-CoV-2 y de los metadatos conexos sirve de apoyo a la respuesta ante el brote de covid-19. Facilita el seguimiento de la propagación geográfica y temporal del SARS-CoV-2 y la pronta detección y evaluación de mutaciones que puedan influir en el poder patógeno o la transmisión del virus o en las medidas de respuesta adoptadas (como las vacunas, el tratamiento y las pruebas diagnósticas)”. Y defiende que "invertir en una red escalonada de secuenciación del SARS-CoV-2 de ámbito mundial permitirá elaborar programas internacionales de secuenciación sólidos y de calidad para detectar y afrontar otros brotes de patógenos que puedan producirse en el futuro”.
La secuenciación del nuevo coronavirus permitió clasificarlo, definirlo e incluirlo en familias de virus ya conocidas; dar con su más que probable origen; conocer cómo se transmite; estudiar su capacidad de difusión y de contagio, y obtener información fundamental para el desarrollo vacunas y, esperemos que pronto, también de fármacos específicos eficaces.
Si se destinan recursos suficientes a esta actividad, además, se detectarán rápidamente, y así se podrán controlar, cepas del virus que pueden llegar a comprometer seriamente ese optimista futuro que ya empiezan a mostrarnos las vacunas contra la covid-19.
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