El Hospital Universitario 12 de Octubre, en Madrid, junto con la Unidad de Investigación en Salud Digital del Instituto de Salud Carlos III -ISCIII- (UITeS), han hecho públicos los resultados de una investigación que propone una novedosa metodología para avanzar y mejorar en el uso de los datos clínicos generados en los centros sanitarios durante la atención y tratamiento de los pacientes con covid-19. El objetivo es conseguir que estos datos puedan reutilizarse y compartirse para labores de investigación, estadística y salud pública, sin que se pierda su contexto y significado.
El estudio, publicado en la revista Journal of Biomedical Informatics, plantea mantener el potencial de estos datos en origen, a través de procesos automatizados y de acuerdo con estándares. Los resultados logrados hasta el momento han sido positivos y han permitido confirmar el propósito de la investigación. “Normalmente, el uso de los datos para cada investigación es único, y un equipo humano se encarga de extraerlos de la historia clínica”, explica Miguel Pedrera, responsable del Área de Datos del Servicio de Informática del 12 de Octubre.
El objetivo del trabajo era lograr que, “gracias a estándares y buenas prácticas de modelado, fuera posible acceder rápidamente a los datos sin necesidad de duplicar el trabajo”.
Desarrollo
La estrategia desarrollada por el equipo de investigadores se basa en la tecnología de Modelos Clínicos Detallados -DCM en inglés, del original Detailed Clinical Models- y se ha llevado a cabo en cuatro fases.
En la primera, se definió un conjunto de variables, identificando 58 conceptos iniciales sobre observaciones de interés en el paciente con covid-19, 22 de ellos de carácter clínico y 36 procedentes de laboratorio. No obstante, esta metodología permite añadir nuevas variables de forma sencilla a medida que se necesitan.
La segunda consistió en la formalización de los conceptos elegidos de las 58 observaciones seleccionadas en la primera fase, utilizando normas y lenguajes clínicos estandarizados como la UNE EN ISO 13606, Snomed-CT y Loinc.
A continuación, en la tercera, se definieron las reglas de transformación y los procedimientos automatizados de extracción de datos y se diseñaron los procedimientos para transformar los datos recogidos en información diseñada para investigación y otros usos secundarios.
Validación
Finalmente, la cuarta fase validó la metodología mediante la generación de informes de casos, de acuerdo a la especificación del Consorcio Internacional de Infecciones Emergentes y respiratorias Agudas Graves de la OMS -Isaric-WHO- para covid-19. Así, se generó el conjunto de datos conforme a los requerimientos de este organismo, de manera automatizada y sin intervención manual, lo que permite ahorrar tiempo y recursos. En concreto, la metodología permitió disponer de información de casi 4.500 pacientes.
Se trata, según Pedrera, de un sistema “flexible y eficiente” que podría, llegado el caso, aplicarse a otras patologías en que se manejen gran cantidad de datos, como el cáncer, la diabetes y las enfermedades cardiovasculares.
La publicación del artículo se enmarca en la serie de proyectos cooperativos, financiados por la Acción Estratégica en Salud del ISCIII sobre normalización y codificación de datos clínicos que se están llevando a cabo entre el 12 de Octubre, la UITeS y el Barcelona Supercomputing Center -BSC-.
Valor desde la entrada del dato
Ahora, el trabajo continúa “revisando la calidad y consistencia de los datos, comparándolos con el gold standard, es decir, la recogida manual”. Los resultados preliminares son “muy buenos”.
No obstante, para que esto sea posible es preciso que el dato sea bueno desde la recogida: “Hasta ahora, las metodologías buscaban transformar datos de dudosa calidad en datos útiles”, mientras que el trabajo desarrollado en el 12 de Octubre busca “transformar la historia clínica electrónica para que las variables de interés, en este caso de covid-19, se cumplimenten debidamente”.
El Hospital 12 de Octubre y el Instituto de Salud Carlos III proponen una nueva metodología para mejorar el uso de los datos en el estudio de la covid-19.
coronavirus Off Rosalía Sierra Profesión Profesión Profesión Off
via Noticias de diariomedico.... https://ift.tt/3zcGyGf
No hay comentarios:
Publicar un comentario