Las nuevas herramientas de proteómica y secuencia masiva suponen un avance importante en el estudio de la resistencia a antibióticos y la tipificación molecular. Sin embargo, su implementación en el laboratorio y su traslación a la clínica no está exenta de dificultades.
Una mesa redonda organizada en el marco del XXIV Congreso Nacional de la Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica ha estado dedicada precisamente al análisis de los retos que se plantean en esta materia.
Antonio Oliver, del servicio de Microbiología del Hospital Universitario Son Espases, en Palma de Mallorca, y comoderador de la mesa, ha destacado el importante reto que supone para los hospitales tratar de reducir la resistencia a los antibióticos y detectar con precisión los mecanismos de trasmisión de las bacterias, “determinando si una agrupación de casos de infección ocasionados por una bacteria se debe o no a una misma cepa”.
En este sentido la proteómica y en concreto la espectrometría de masas, con pruebas como el Maldi Tof, ha despertado importantes expectativas “no solo para identificar una bacteria sino para determinar mecanismos de resistencia", ha señalado Antonio Oliver.
Maldi Tof
El término Maldi responde a las siglas en inglés de Matrix Assisted Laser Desorption Ionization (desorción/ionización láser asistida por matriz) y Tof de Time-Of-Flight, de modo que permite una ionización suave sobre la muestra a analizar, es decir, el microoganismo en cuestión, y de esta manera la identificación del mismo a través de conjuntos de épicos proteicos o espectros que genera en una cuestión de pocos segundos.
German Bou, del servicio de Microbiología del Hospital Universitario de A Coruña y el Instituto de Investigación Biomédica de dicha ciudad, ha precisado que estas técnicas de diagnóstico se implementaron inicialmente en los laboratorios para identificar microorganismos de manera rápida y actualmente se están utilizando también para detectar resistencia a los antibióticos y poder tomar decisiones rápidas. “En algunos casos incluso para la detección temprana de clones de alto riesgo bacterianos”, ha señalado este especialista.
En concreto el Maldi Tof permite determinar el perfil proteico de una bacteria y desde hace unos años se trata de probar su utilidad para evaluar resistencias. En este sentido, Bou ha destacado que las evidencias más fundamentadas se han conseguido en el grupo de los betalactámicos y, en concreto, en carbapenémicos, lo cual tiene una alta importancia clínica. “Nuestro grupo ha demostrado su utilidad en detectar infecciones urinarias causadas por bacterias resistentes a los carbapenémicos por producción de enzimas carbapenemasas”, ha apuntado Germán Bou.
Superior a PCR
En este caso concreto su utilidad puede ser superior a la de las pruebas de tipo PCR ya que el Maldi Tof “nos permite determinar la resistencia independientemente del mecanismo, mientras que la PCR realiza una detección dirigida al mecanismo, lo cual puede generar falsos negativos en el caso de genes de resistencia raros o poco frecuentes”.
No obstante, el inconveniente con esta técnica radica en que no se puede aplicar directamente a una muestra clínica sino a las colonias aisladas y solo en caso de hemocultivos positivos y muestras de orina con alta carga bacteriana.
Técnica complementaria, no sustitutiva
La conclusión para Germán Bou es que se trata de una técnica no tanto sustitutiva sino complementaria en el caso de la detección de resistencias a antimicrobianos y “que nos puede resultar muy útil como método de diagnóstico diferente con aplicaciones concretas y para situaciones determinadas, sumándose al arsenal diagnóstico de que disponemos con otros métodos como pruebas PCR”.
En lo que a la tipificación bacteriana se refiere la espectroscopía de infrarrojos con transformada de Fourier se posiciona como una técnica muy prometedora en los laboratorios de microbiología clínica, según ha indicado Germán Bou.
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