Investigadores del Área de Bioinformática Clínica de la Fundación Progreso y Salud han analizado e interpretado los datos obtenidos de la secuenciación del genoma del virus del Nilo Occidental en Andalucía, un trabajo que permite conocer mejor el comportamiento de la enfermedad que desencadena (meningoencefalitis) y frenar posibles brotes de cara al futuro.
El virus del Nilo Occidental se transmite por el mosquito del género Culex, común en la región andaluza. Según informa la Consejería de Salud y Familias de Andalucía, durante este verano, en los últimos días, se han confirmado tres nuevos casos: dos en Coria del Río y uno en Villamanrique de la Condesa, ambos municipios de la provincia de Sevilla.
Una mujer de la primera localidad, con patologías previas graves, ha fallecido y las otras dos personas ya han recibido el alta médica.
Investigación tras el brote de agosto de 2020
El estudio, que se ha publicado en la revista internacional Viruses y se ha realizado en colaboración con el Servicio de Vigilancia y Salud Laboral que coordina el Sistema de Vigilancia Epidemiológica de Andalucía, se inició tras el brote del virus del Nilo acaecido en agosto de 2020 en Andalucía y Extremadura, y que se saldó con 71 afectados y 8 fallecidos.
El grupo de investigación liderado por Joaquín Dopazo, director del Área de Bioinformática Clínica, ha analizado por primera vez en Andalucía el genoma de este virus y ha creado un mapa epidemiológico.
Con él es posible realizar un estudio filogenético, mostrando sus variantes, sus características y su origen potencial. “Con este mapa no solo se ven las variantes registradas en Andalucía sino también aquellas que se han identificado en otros países, por lo que podemos establecer comparativas y anticiparnos a posibles brotes que puedan surgir”, explica Dopazo.
En esta investigación los científicos concluyen que existen dos hipótesis sobre el origen del virus del Nilo en el brote de Andalucía. Por una parte, una presencia en la zona mediterránea que se diversifica y emerge en diferentes localizaciones y, por otra, un reservorio viral endémico de Italia, donde el virus parece estar permanentemente activo con brotes continuos cada año desde 2008.
Ocho linajes del virus
Filogenéticamente, el virus del Nilo Occidental se clasifica en ocho linajes, aunque las cepas altamente patógenas pertenecen principalmente a los linajes 1 y 2 y, de hecho, los científicos han constatado la presencia del linaje 1 en el brote del año pasado en Andalucía.
Los resultados de este estudio se encuentran disponibles en una plataforma vinculada al Sistema Integral de Epidemiología Genómica de Andalucía (SIEGA) donde se ofrece una vista interactiva de la filogenia completa del virus del Nilo Occidental con las cuatro secuencias completas pertenecientes al brote español de 2020 en el contexto del resto de secuencias virales disponibles pertenecientes a brotes mundiales que han sido secuenciadas en anteriores años.
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